Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr88Q9EPB7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr88Q9EPB7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr88Q9EPB7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr88Q9EPB7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr88Q9EPB7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms