Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trmt112Q9DCG9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms