Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb6Q9DC29 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb6Q9DC29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms