Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf6Q9DBU5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms