Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Znf580Q9DB38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Znf580Q9DB38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Znf580Q9DB38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Znf580Q9DB38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Znf580Q9DB38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Znf580Q9DB38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Znf580Q9DB38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Znf580Q9DB38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Znf580Q9DB38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Znf580Q9DB38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Znf580Q9DB38 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf580Q9DB38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Znf580Q9DB38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms