Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pop5Q9DB28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pop5Q9DB28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pop5Q9DB28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms