Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp12Q9D9M2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Usp12Q9D9M2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Usp12Q9D9M2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Usp12Q9D9M2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Usp12Q9D9M2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp12Q9D9M2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Usp12Q9D9M2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Usp12Q9D9M2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Usp12Q9D9M2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Usp12Q9D9M2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Usp12Q9D9M2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms