Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actrt1Q9D9J3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actrt1Q9D9J3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms