Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4bQ9D9F7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4bQ9D9F7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4bQ9D9F7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms