Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700123K08RikQ9D991 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700123K08RikQ9D991 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms