Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg7Q9D906 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 303.2 ms