Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc52a2Q9D8F3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc52a2Q9D8F3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc52a2Q9D8F3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms