Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms