Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af1Q9D883 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1Q9D883 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms