Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fip1l1Q9D824 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fip1l1Q9D824 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fip1l1Q9D824 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Fip1l1Q9D824 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fip1l1Q9D824 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms