Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbe1Q9D6Y9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms