Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hspb11Q9D6H2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hspb11Q9D6H2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspb11Q9D6H2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms