Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra4Q9D6F4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra4Q9D6F4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms