Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc9bQ9D6E4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc9bQ9D6E4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc9bQ9D6E4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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