Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn11Q9D572 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn11Q9D572 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms