Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3a3Q9D554 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms