Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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