Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms