Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2al3Q9D4U4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms