Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931423N10RikQ9D4J9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931423N10RikQ9D4J9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms