Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf3Q9D4H7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms