Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efhc2Q9D485 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhc2Q9D485 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms