Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap53Q9D439 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap53Q9D439 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms