Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933428M09RikQ9D3X3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933428M09RikQ9D3X3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms