Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx29Q9D3S3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx29Q9D3S3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx29Q9D3S3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms