Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z6

9130008F23Rik, 9130008F23Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130008F23RikQ9D2Z6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9130008F23RikQ9D2Z6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9130008F23RikQ9D2Z6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9130008F23RikQ9D2Z6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9130008F23RikQ9D2Z6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9130008F23RikQ9D2Z6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9130008F23RikQ9D2Z6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9130008F23RikQ9D2Z6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9130008F23RikQ9D2Z6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9130008F23RikQ9D2Z6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms