Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc8Q9D2H8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc8Q9D2H8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc8Q9D2H8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms