Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc6bQ9D289 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms