Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab1bQ9D1G1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab1bQ9D1G1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms