Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1lQ9D1E5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1lQ9D1E5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbr1lQ9D1E5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms