Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gtf2e1Q9D0D5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms