Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acbd6Q9D061 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acbd6Q9D061 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acbd6Q9D061 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms