Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms