Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms