Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
3100002H09RikQ9CXW6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
3100002H09RikQ9CXW6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms