Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Sgo1Q9CXH7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms