Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx10Q9CWT3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snx10Q9CWT3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx10Q9CWT3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms