Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BccipQ9CWI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BccipQ9CWI3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms