Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Sycp2Q9CUU3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Sycp2Q9CUU3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms