Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms