Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc5Q9CRA8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms