Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NmbQ9CR53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NmbQ9CR53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NmbQ9CR53 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms