Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vta1Q9CR26 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vta1Q9CR26 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vta1Q9CR26 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vta1Q9CR26 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vta1Q9CR26 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vta1Q9CR26 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vta1Q9CR26 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vta1Q9CR26 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vta1Q9CR26 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms