Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop4Q9CR08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop4Q9CR08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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