Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rwdd1Q9CQK7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd1Q9CQK7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms